Il Sir2 attraversa Padova da ovest a est. Il capolinea è nel Comune di Rubano, nell’area al confine con il Comune di Mestrino tra via Pria Fosca, via Palù, via Geremia e la strada regionale SR7. Da lì segue la SR7 fino ad arrivare su via Chiesanuova, alla caserma Romagnoli (dove sorge il capolinea intermedio), poi via Vicenza, Corso Milano, Piazza Insurrezione, Piazza Garibaldi, Corso del Popolo, stazione ferroviaria, via Tommaseo, la Stanga, via Venezia, via San Marco fino ad arrivare nel Comune di Vigonza, dove attualmente il capolinea è previsto in corrispondenza della rotonda tra via Padova e via Regia.
In questo percorso tocca molti punti strategici della città: il quartiere Chiesanuova, la Caserma Romagnoli, il Parco delle Mura di San Benedetto (ex caserma Prandina), il Teatro Verdi, la Stazione di Padova, il Tribunale, la Fiera, l’Università, la nuova questura, il nuovo ospedale di Padova Est.
